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教育背景
2003―2006 上海交通大学 机械设计及理论专业 博士
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工作经历
2018― 上海交通大学 生物医学制造与生命质量工程研究所 研究员、博士生导师
2010―2018 上海交通大学 生物医学制造与生命质量工程研究所 副研究员、博士生导师
2008―2010 上海交通大学 生物医学制造与生命质量工程研究所 讲师
2006―2008 上海交通大学 生物医学制造与生命质量工程研究所 师资博士后
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出访及挂职经历
2011.10―2012.10 哈佛大学 医学院 Research Fellow(国家留学基金委全额资助)
2013.09―2013.12 法国科学院(CNRS) TIMC-IMAG实验室 高级访问学者
2015.06―2015.09 比利时鲁汶大学 医学院 高级访问学者
2016.06―2016.08 英国谢菲尔德大学 机械系 高级访问学者
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研究方向
人工智能与医疗
手术导航、手术机器人
虚拟现实/增强现实/混合现实
3D打印、CAD/CAM与数字医疗
医学图像处理、计算机图形学
计算机辅助手术
本研究方向为信息科学、机械工程与现代医学的交叉前沿与热点领域。课题组常年招收博士生/硕士生,将为每位同学提供一流的科研条件与个人发展环境,特别欢迎对学术研究有浓厚兴趣、并有坚实计算机编程基础的学生报考。本团队已与哈佛大学、法国科学院(CNRS)、比利时鲁汶大学、英国伦敦大学学院/谢菲尔德大学/利兹大学、德国明斯特大学、瑞典皇家理工学院、以色列希伯来大学、奥地利格拉兹工业大学、香港中文大学等世界一流大学著名学者建立了长期深入的实质性合作关系,并有国际合作基金支持,依托科技部、教育部、国家自然科学基金、中英/中法/中德/中比/中瑞/中以国际交流合作项目,优秀者将有进入上述学府交流与深造的机会。
本团队每年均有一批研究成果发表于本领域的国际权威期刊及著名国际会议,连续多年有研究生获得国家奖学金、上海市优秀毕业生、著名国际国内学会奖项、上海市“挑战杯”特等奖等,其中,1人获首批国家自然科学基金博士研究生项目,2人获国际计算机辅助手术学会ISCAS Student Scholarship Award(该奖项2009年首次颁奖,每届CARS会议在全球范围内评选1-4位博士生,10余年来仅有2位中国大陆学生获得该奖项,均来自于本团队)、9人获上海市优秀毕业生、9人获国家奖学金、11人获“莙政学者” 基金(该基金由李政道夫妇设立,每年全校仅遴选50对师生组合)。团队多年来已形成了“传帮带”团结互助、朝气蓬勃、追求卓越、刻苦拼搏、积极快乐的科研文化,热忱欢迎海内外英才加盟!
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科研项目
主持国家自然科学基金重点项目、面上项目、国际合作交流项目、科技部“十四五”国家重点研发计划项目、“十三五”<智能机器人>国家重点研发计划课题、教育部、上海市科委、重要产学研合作等项目30余项,代表性项目如下:
2023-2028 国家自然科学基金重点项目(项目编号:82330063),负责人
2011―2015 国家自然科学基金“基于力反馈与视频穿透式增强现实环境下骨科手术规划与导航技术的研究”,负责人
2010―2013 国家自然科学基金“基于虚拟现实的个性化口腔颌面外科医疗辅具的数字化制造与实验研究”,负责人
2015―2017 国家自然科学基金“基于虚拟现实的个性化骨盆肿瘤切除手术仿真系统的研究”,负责人
2019-2023 国家自然科学基金(项目编号:81971709),负责人
2020-2023 国家自然科学基金(项目编号:82011530141),负责人
2020-2022 国家自然科学基金(项目编号:M-0019),负责人
2018-2020 国家自然科学基金(海外及港澳学者合作研究基金,项目编号:81828003),中方主持,执行负责人
2022-2024 “十四五”国家重点研发计划项目(项目编号:2022YFE0197900),负责人
2017-2021 “智能机器人”国家重点研发计划课题(项目编号:2017YFB1302903),负责人
2017-2021 “增材制造与激光制造”国家重点研发计划课题一(项目编号:2017YFB1104101)子课题,负责人
2013―2015 上海市浦江人才计划项目(项目编号:13PJD018),负责人
2020―2023 上海市科委科技创新行动计划项目(项目编号:20490740700),负责人
2019―2022 上海市科委科技创新行动计划项目(项目编号:19510712200),负责人
2015―2018 上海市科委科技创新行动计划项目(项目编号:15510722200),负责人
2016―2019 上海市科委科技创新行动计划项目(项目编号:16441908400),负责人
2014―2017 上海市科委科技创新行动计划项目(项目编号:14441901002),负责人
2018―2020 教育部中法蔡元培国际合作项目,负责人
2012―2012 中法国际合作PHC Xu Guangqi项目,负责人
2014―2016 中比国际合作SJTU-KU Leuven项目,负责人
2017―2018 中瑞国际合作SJTU-KTH项目,负责人
2011―2011 法国科研创新人才计划(FTI)项目,负责人
2015―2017 上海市青浦区科委产学研项目(项目编号:15Z128010008),负责人
2007―2008 中国博士后科学基金项目“三维数字化口腔种植外科定位导向模板的研制与应用”,负责人
2010―2011 国家重点实验室开放课题(项目编号:MSV-2010-09),负责人
2014―2016 江苏省重点实验室项目(项目编号:14Z1170010005),负责人
2011―2012 国家863重点项目“颅颌面外科精确治疗机器人系统”子课题“颅颌面外科手术培训系统”,第2项目负责人
2010―2013 国家自然科学基金项目“基于C形臂2D投影的多元3D脊柱模型构建研究”,第2项目负责人
2020-2023 上海交通大学医工(理)交叉研究基金重点项目:“基于人工智能的新型反向肩关节置换手术规划与导航系统的研发”,工学方负责人
2018-2021 上海交通大学医工(理)交叉研究基金重点项目:“下颌骨重建手术机器人关键技术研究及临床前应用”,工学方负责人
2016-2019 上海交通大学医工(理)交叉研究基金重点项目:“面向狭窄空间精准颧种植手术机器人及实时导航关键技术研究”,工学方负责人
2012-2015 上海交通大学医工(理)交叉研究基金重点项目:“基于增强现实的骨肌系统手术导航关键技术研究与设备集成开发”,工学方负责人
2009―2011 上海交通大学医工(理)交叉研究基金:“基于增强现实的上颌骨缺损种植修复手术导航系统的关键技术研究”,负责人
2009―2011 上海交通大学医工(理)交叉研究基金:“基于数据库颌骨重建分析系统的关键技术研究及临床应用”,工学方负责人
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代表性论文专著
在IEEE TMI、IEEE TBME、IEEE TVCG、IEEE JBHI、Medical Image Analysis等国内外重要刊物及MICCAI、IEEE-EMBS、CARS等著名国际会议上共发表学术论文200余篇,代表性论文如下:
1.Bolun Zeng, Huixiang Wang, Jiangchang Xu, Puxun Tu, Leo Joskowicz, Xiaojun Chen*. Two-Stage Structure-focused Contrastive Learning for Automatic Identification and Localization of Complex Pelvic Fractures. IEEE Transactions on Medical Imaging. 2023; 42(9): 2751-2762.
2. Enpeng Wang,Yueang Liu,Puxun Tu,Zeike A. Taylor, Xiaojun Chen*. Video-based Soft Tissue Deformation Tracking for Laparoscopic Augmented Reality-based Navigation in Kidney Surgery. IEEE Transactions on Medical Imaging.2024; https://doi.org/10.1109/TMI.2024.3413537
3.Jiaxuan Liu , Haitao Li, Bolun Zeng , Huixiang Wang, Ron Kikinis, Leo Joskowicz, Xiaojun Chen*. An End-to-End Geometry-Based Pipeline for Automatic Preoperative Surgical Planning of Pelvic Fracture Reduction and Fixation. IEEE Transactions on Medical Imaging.2024; https://doi.org/10.1109/TMI.2024.3429403
4.Bolun Zeng, Huixiang Wang, Xingguang Tao, Haochen Shi, Leo Joskowicz, Xiaojun Chen*. A bidirectional framework for fracture simulation and deformation-based restoration prediction in pelvic fracture surgical planning. Medical Image Analysis. 2024; 97:103267.
5.Puxun Tu, Hongfei Ye, Haochen Shi, Jeff Young, Meng Xie, Peiquan Zhao, Ce Zheng*, Xiaoyi Jiang, Xiaojun Chen*.Phase-specific augmented reality guidance for microscopic cataract surgery using spatiotemporal fusion network. Information Fusion. 2024.102604.
6.Bolun Zeng,Li Chen,Yuanyi Zheng*,Xiaojun Chen*. Adaptive Multi-dimensional Weighted Network with Category-aware Contrastive Learning for Fine-grained Hand Bone Segmentation.IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics.2024;28(7):3985-3996. (封面及亮点论文)
7. Mingjun Gong, Xiaojun Chen*. 3D Surface-Closed Mesh Clipping Based on Polygonal Partitioning for Surgical Planning. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 2024; 30 (7): 3374-3385.
8. Yizhou Chen, Shuojie Gao, Puxun Tu, Xiaojun Chen*. Automatic 3D Teeth Reconstruction from Five Intra-oral Photos Using Parametric Teeth Model. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 2024;30(8): 4780-4791
9. Puxun Tu,Pingping Hu,Junfeng Wang,Xiaojun Chen*. From Coarse to Fine: Non-Rigid Sparse-Dense Registration for Deformation-Aware Liver Surgical Navigation.IEEE Transactions on Biomedical Engineering. 2024; https://doi.org/10.1109/TBME.2024.3386704
10.Puxun Tu, Chunxia Qin, Yan Guo, Dongyuan Li, Abel J Lungu, Huixiang Wang, Xiaojun Chen*. Ultrasound image guided and mixed reality-based surgical system with real-time soft tissue deformation computing for robotic cervical pedicle screw placement. IEEE Transactions on Biomedical Engineering. 2022; 69 (8): 2593-2603.
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教学工作
程序设计思想与方法 本科生,48学时,3学分
机械设计基础 本科生,48学时,3学分
现代控制理论 研究生,48学时,3学分
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软件版权登记及专利
(1) 发明专利: 联合支持型计算机辅助口腔种植定位导向模板的制作方法(专利号:ZL 200910048727.6,授权公告号:CN101530349B)
(2) 发明专利:用于校准手术器械的校准块(专利号:ZL 201410396220.0,授权公告号:CN 104146773 B)
(3) 发明专利:一种多位置跟踪仪的工具定位装置(专利号:ZL 201810542286.4,授权公告号:CN108742841B)
(4) 发明专利:一种游离骨块位置中时跟踪的标定装署(专利号:ZL201810381890.3,授权公告号:CN108652740B)
(5) 发明专利:一种球形定位头架(专利号:ZL 201410396240.8,授权公告号:CN104146774B)
(6) 软件著作权:口腔种植手术规划软件 CAPPOIS V1.0(软著登字第 2029594 号)
(7) 软件著作权:手术导航系统软件 Beidou SNS V1.0(软著登字第 2839021 号)
(8) 软件著作权:手术规划系统 SurgiPlan(软著登字第 3213037 号)
(9) 软件著作权:数字化骨科解剖参数三维测量软件(软著登字第 2744397 号)
(10) 软件著作权:计算机辅助 3D 打印导板设计软件(软著登字第 331947 号)
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学术兼职
医学图像计算领域权威期刊Computerized Medical Imaging and Graphics (Elsevier出版社,JCR一区) 副主编
国际医学物理与工程学会(IPEM)会刊Medical Engineering & Physics(Elsevier出版社) 常务副主编(Deputy Editor-in-chief)
国际医学物理与工程学会(IPEM)会刊Physics in Medicine & Biology (IOP出版社,中科院分区表TOP期刊) 执行编委
IEEE Transactions on Medical Robotics and Bionics 副主编
国际计算机辅助手术学会会刊International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery (Springer出版社) 编委
国际临床机器人手术学会(CRSA)会刊International Journal of Medical Robotics and Computer Assisted Surgery (Wiley出版社) 编委
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (JCR一区) 编委
Expert Review of Medical Devices( Taylor & Francis出版社) 编委
Computer Assisted Surgery( Taylor & Francis出版社) 副主编
Journal of Mechanics in Medicine and Biology(SCI Indexed) Editorial Advisor Board委员
全国医用机器人标准化技术归口单位专家组成员
中国计算机学会(CCF)数字医学分会执行委员
中国图象图形学学会(CSIG)医学影像专业委员会委员
国际计算机辅助口腔种植学会(CAI, Computer Aided Implantology Academy)理事会委员
国际数字口腔医学学会(DDS, Digital Dentistry Society)理事会委员
国际矫形与创伤外科学会(SICOT)中国部数字骨科学会委员
中国整形美容协会精准与数字医学分会常务理事、颅颌面整复专业委员会副主任委员
欧洲研究理事会(ERC)外审评议专家
葡萄牙国家科学技术基金委(FCT)外审评议专家
荷兰科学基金委(NWO)外审评议专家
以色列科技部外审评议专家
长期担任本领域权威期刊 MedIA, IEEE-TMI, IEEE-TBME, IEEE-JBHI, IEEE-TMECH, IJCARS, IJMRCAS, CMPB, CIBM, MEP, CMIG, CAS, CMBBE, JIM等审稿人
欧洲生物医学工程学会(ESEM, the European Society for Engineering and Medicine)会员
中国生物医学工程学会高级会员
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荣誉奖励
教书育人荣誉奖励:
2022 德赢vwin055“最佳导师”
2014 德赢vwin055研究生“最受欢迎导师”
2021 作为指导教师,指导学生获上海市“挑战杯”特等奖
2022 作为指导教师,指导博士生获中国生物医学工程学会“青年优秀论文报告奖”(“治疗计划、导航与机器人辅助”分会场唯一获奖研究生)
2022 作为指导教师,指导学生获校优异学士学位论文(Top 1%)
2023 作为指导教师,指导学生获上海市“挑战杯”一等奖
2023 作为指导教师,指导学生获第19届亚洲计算机辅助手术国际会议(ACCAS 2023)优秀论文奖
2023 作为指导教师,指导学生获第13届国际生物医学工程与技术会议(ICBET 2023)最佳报告奖
2023 作为指导教师,指导学生获中国生物医学工程大会青年优秀论文竞赛(研究生)一等奖
2024 作为指导教师,指导学生获首批国家自然科学基金博士研究生项目
2024 作为指导教师,指导研究生获第九届全国大学生生物医学工程创新设计大赛一等奖(Top 5%)
科研荣誉奖励:
2019 国家科学技术进步奖二等奖(排3)
2013 上海市浦江人才计划
2011 上海市白玉兰科技人才基金
2014 上海市科协飞翔计划
2011 法国科研创新人才计划(FTI,全国共7名)
2011 上海交通大学SMC优秀青年教师奖励计划(B类)
2011 上海交通大学优秀博士后
2017 江苏省科学技术奖三等奖(排1)
2016 华夏医学科技奖
2018 中华口腔医学会科技奖二等奖
2010 “图像引导手术关键技术的研究与产品开发”, 上海市科技进步奖二等奖
2008 “计算机辅助牙种植外科定位导向模板的研究”,第六届上海医学科技奖